En 1998, John Frusciante salió de rehabilitación y volvió a la banda, y su regreso revolucionó el sonido de los Peppers. 'Californication' fue el séptimo disco, grabado después de años de silencio y de que la banda se tomara un descanso. Las sesiones fueron emocionales, con Frusciante tocando como si hubiera estado esperando ese momento toda su vida. El título, 'Californicación', es un juego entre la palabra 'California' y 'Forget' (olvido), una crítica a la cultura superficial de Los Ángeles. Las letras exploran temas de nostalgia, adicción y la industria del cine.
El sonido de 'Californication' es más melódico y menos funk que en sus discos anteriores. 'Scar Tissue' es la primera obra maestra, una balada rock con una guitarra melódica y una letra sobre la cicatrización. 'Otherside' es un tema alternativo con un riff de guitarra hipnótico. 'Californication' es una crítica a la cultura de Hollywood, con un solo de guitarra de Frusciante. 'Around the World' es un funk rock más acelerado. 'Easily' y 'Road Trippin' completan un disco redondo. La producción de Rubin es más clara y espaciada.
El impacto de 'Californication' fue inmenso: debutó en el número 3 del Billboard y vendió más de 15 millones de copias. La crítica lo aclamó como un regreso triunfal. Con el tiempo, es considerado uno de los mejores discos de la banda y del rock de los 90. Su legado es el de una californicación, un sueño dorado y una crítica a la vez.